Naslovna  > Znanost > Projekti financirani sredstvima Hrvatske zaklade za znanost > HRZZ > Otkrivanje biomarkera za bolest Hashimotov tireoiditis koristeći multi-omics pristup

Naziv HRZZ Istraživačkog projekta:
Otkrivanje biomarkera za bolest Hashimotov tireoiditis koristeći multi-omics pristup
 
Akronim projekta: HT-OMICS
Trajanje projekta:  31.12.2023. - 30.12.2027.
Voditelj projekta: prof.dr.sc. Vesna Boraska Perica

Suradnici na projektu: 
prof.dr.sc. Ante Punda,
doc.dr.sc. Ana Barić Žižić,
doc.dr.sc. Vesela Torlak Lovrić,
dr.sc. Dean Kaličanin,
mr.sc. Maja Cvek,
Marko Vuletić, dr.med,
Vanna Žnidar, univ.mag.math,
Ivana Listeš, univ.mag.biol.mol.
prof.dr.sc. Eleftheria Zeggini,
dr.sc. So-Youn Shin
 

 

Opis projekta:

Hashimotov tireoiditis (HT) je najučestalija autoimuna bolest današnjice. Molekularni mehanizmi u podlozi bolesti još uvijek nisu dovoljno poznati, stoga je ovaj projekt usmjeren na otkrivanje novih znanja vezanih uz molekularne i biološke putove vezane uz HT. Ovaj projekt predstavlja nastavak prethodne HRZZ Uspostavne potpore u kojoj je osnovana CRO-HT biobanka bioloških uzoraka i fenotipova za 500 ispitanika oboljelih od HT-a te je provedena cjelogenomska analiza povezanosti (GWAS). U međuvremenu smo prikupili još 200 kontrolnih ispitanika te u predloženom projektu kroz cilj 1 (C1 Proširenje CROHT biobanke) planiramo uključiti dodatnih 200 ispitanika s HT-om te genotipizirati njihov genom. Također, planiramo mjeriti i analizirati proteinske i metaboličke markere kroz ciljeve 2 (C2 Otkrivanje biomarkera koristeći proteomsko profiliranje) i 3 (C3 Otkrivanje biomarkera koristeći metabolomsko profiliranje). Kroz ove ciljeve ćemo nastojati: (a) identificirati različito izražene proteinske/metaboličke markere između HT ispitanika i kontrola i ispitati povezanost omics profila s težinom bolesti HT; (b) utvrditi povezanosti između značajnih markera i kliničkih obilježja HT-a; (c) integrirati sve dostupne omics podatke (cjelogenomske genotipove, proteom i metabolom) da bi dobili bolji uvid u manifestaciju same bolesti; (d) ispitati postojanje uzročnih povezanosti između značajnih markera (metabolita i proteina) i HT-a koristeći metodu Mendelove randomizacije. Kroz posljednji cilj 4 (C4 Istraživanje uloge crijevne propusnosti s HT-om) planiramo mjerenje i analiziranje proteina zonulina  koji je trenutno jedini mjerljivi marker crijevne propusnosti. Predloženi sveobuhvatni istraživački pristup pridonijet će razumijevanju temeljnih bioloških putova povezanih s mehanizmima nastanka HT-a i identifikaciji biomarkera koji mogu služiti pri stvaranju prediktivnih modela za razvoj te do razvoja novih terapijskih, prevencijskih i dijagnostičkih metoda.

Pozvana predavanja:

   prof.dr.sc. Vesna Boraska Perica

Kongresni sažeci:

     Vanna Žnidar, univ.mag.math. i mentorica prof.dr.sc. Vesna Boraska Perica - Poster

Znanstveni radovi:

Vuletić M, Žnidar V, Barić Žižić A, Sladić S, Kaličanin D, Torlak Lovrić V, Cvek M, Punda A, Boraska Perica V. Recreational Exercise and Inflammatory Patterns in Hashimoto’s Thyroiditis: Observations from a Cross-Sectional Study. Biomolecules 2025;15.

Edukacije:

Vanna Žnidar, univ.mag.math., sudjelovala je na stručnoj edukaciji “Training on Employing the Helmholtz Munich Imputation Server (HMIS)” održanoj 24.-28. studenoga 2025. u Institutu za translacijsku genomiku Helmholtz Munich, usmjerenoj na teorijske i praktične aspekte imputacije genetskih podataka. Edukacija je obuhvatila odabir parametara, kontrolu kvalitete podataka prije i nakon imputacije te sigurnu pohranu i obradu podataka u skladu s GDPR-om.
 

 

Vanna Žnidar i njezin tim sudionika na Volos Summer School of Human Genetics 2025.